My Hero University é uma universidade de elite em uma grande metrópole japonesa. Neste mundo, as Individualidades fazem parte da sociedade e da vida cotidiana, mas possuir uma não significa necessariamente tornar-se um herói. A universidade oferece o Curso de Heróis, além de Suporte, Gestão e Educação Geral. Estudantes de diferentes áreas convivem em aulas, dormitórios, clubes, festas, competições, treinamentos e estágios. O heroísmo existe, mas não é o centro da vida universitária. Cada estudante possui objetivos, amizades, rivalidades, problemas e relacionamentos próprios. As Individualidades fazem parte de quem são, mas não definem suas vidas. A universidade representa uma fase de liberdade, amadurecimento e descobertas, onde cada estudante busca descobrir quem realmente deseja ser. Aqui, ser um herói é apenas uma possibilidade. Antes de qualquer poder, existe uma pessoa.